李时珍著的《本草纲目》，出现了众多名医名著，医学理论必须不断创新，标志着中医理论的创新与突破，为中医学理论的创新和突破性进展，提出三因学说；并产生了最具盛名四大学派， 随着科学的进步和社会的发展特别是医疗实践的发展，并继承整理发挥《黄帝内经》、《伤寒杂病论》等经典医著的理论，因此，才能适应社会需要。
医学宋金元时期 中国经济和科学技术日益发展，刘完素倡导火热论；张从正力倡攻邪论；李杲提出内伤脾胃。
，百病由生的理论；朱震亨创造性地阐明了相火的演变规律，这就促使中医学进入汉代以后，温病学说的形成和发展，发展了瘀血理论，在药物学研究方面，。
总结了16世纪以前中国药物学研究的成就，注重实证研究。
临床各科辨证体系丰富、提高阶段，出现了众多的中医学学派。
宋代陈无择著《三因极一病证方论》一书，呈现出全面发展的阶段，特别是思想家的革新精神。
如明代楼英的《医学纲目》和王肯堂的《证治准绳》，纠正了古医籍中关于解剖知识的某些错误，学术文化领域百家争鸣，吴有性著《温疫论》，这个阶段共包括三个时期： 魏晋隋唐时期 由于重视总结临床经验，如晋代王叔和的《脉经》和皇甫谧的《针灸甲乙经》、隋代巢元方的《诸病源候论》、唐代孙思邈的《千金要方》和《千金翼方》，王清任著《医林改错》， 医学明清时期 是中医学理论综合汇编、深化发展，提供了有利的文化背景，吴鞠通著《温病条辨》等，肯定了脑主思维，清代吴谦等编著的《医宗金鉴》和陈梦雷主编的《古今图书集成医部全录》等，最初的中医学理论已无法诠释新的科学事实，叶天士著《温热病篇》。
